崇祯十二年(1639年)入阁，加太子少保，文渊阁大学士，任户部尚书参与机要。
明恭宅心仁厚，曾致信告诫其弟居恭(任剑州牧)“洁已爱民，虚心听狱，严胥役，禁家奴。”
他与熊文灿关系很好，因着这层关系，本不欲出声，但现在不得不出来说话道：“东南府孙承宗有信来，说关于罪犯逃窜至两边之事，可作‘引渡’！”
“即大明罪犯逃到东南府，由闽省派人前往台湾进行交涉，按其罪行，严重该当杀头者可以把他们捉回来，普通罪犯则留在东南府服刑进行劳动改造！”
他的话出口，引发清流狂喷：“我早就说过他与东南府勾结在一起了！”
姚明恭不受影响，继续道：“至于熊文灿，东南府不能把他交出来，乃是尽孝，亲亲相隐！”
此话倒是有理，清流不能否认，气焰为之减弱。
原来在古代，百善孝为先，若父有过，子可代父服刑，是为“美德”！
亲亲相隐，乃是古代刑律的一项原则，亲属之间有罪则应该互相隐瞒，不告发和不作证，同样是为美德，反之则论罪。
大家心忖：“老熊还真的找了个好女婿啊！”
当天的朝会在乱哄哄中结束，哪怕清流心有不甘，但苦b的明朝又闹出大漏子，清流也不能再抓住熊文灿不放，事情不了了之。
苏州巡抚八百里加急：苏、松、湖地区大雨滂沱，淹没地方！
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